Bio-informaticus Medische Genetica


Het Centrum Medische Genetica (CMG) is een sterkgroeiende dienst binnen het Universitair Ziekenhuis Antwerpen (UZA) en de Universiteit Antwerpen (UA). In totaal zijn momenteel meer dan 120 medewerkers (artsen, verpleegkundige, genetische consulenten, onderzoekers, bio-informatici, laboranten, secretaresses,…) werkzaam in het CMG. Het CMG is één van de 8 erkende genetische centra in België. Het maakt tevens een onderzoeksexcellentieconsortium uit (GENOMED) binnen de Universiteit Antwerpen. Het CMG streeft naar kwalitatief hoogwaardige diagnostiek en voorlichting voor erfelijke en aangeboren ziekten in de ruime regio Antwerpen. Het CMG is betrokken in het Vlaams Netwerk voor Zeldzame ziekten en momenteel lid van drie Europese Referentienetwerken voor zeldzame aandoeningen (BOND, ITHACA, VASCERN). Het richt zich op erfelijkheidsadvisering en genoomdiagnostiek, gebruik makend van state-of-the-art technieken. Vanwege een sterk toegenomen vraag naar bio-informatische ondersteuning in de genoomdiagnostiek heeft onze dienst behoefte aan een voltijdse bio-informaticus.

Wat ga je doen?

  • je staat in voor de implementatie en het onderhoud van bio-informatica "pipelines" voor de diagnostiek van genetische aandoeningen waarbij we verwijzen naar de niet-invasieve prenatale test (NIPT), exoom sequenering en op korte termijn ook volledige genoom sequenering. Hierbij wordt gewerkt op zowel lokale HPC omgevingen als cloud omgevingen.
  • je beheert, valideert en documenteert de bio-informatica systemen en bijhorende software.

Wat verwachten we van jou?

  • je behaalde een master diploma in de (biomedische) wetenschappen, computerwetenschappen of bio-informatica;
  • je heeft een aantoonbare interesse in de medische genetica en bent voldoende vertrouwd met algemene begrippen uit de humane genetica;
  • je hebt een basiskennis van moleculaire biologie en gentechnologie (eerste en tweede generatie sequenering, array-gebaseerde genoomanalyse, qPCR etc...); 
  • je werkt goed in teamverband en hebt uitstekende communicatieve vaardigheden;
  • je ervaring met meerdere van volgende items: Linux, Shell scripting en Linux command line tools (sed, awk, grep...), scripting-talen (Python, PHP, perl), statistische programmeertalen (R), databanken (bvb. MySQL, MongoDB), container technologie (Docker, singularity), bio-informatica tools: mapping algoritmen (BWA, Bowtie), GATK, samtools, pipeline technologie (Cromwell, snakemake), AWS Cloud computing.

Wat biedt het UZA als werkgever?

  • voltijds bediendecontract voor onbepaalde duur;
  • ruime bijscholingsmogelijkheden;
  • recuperatie 40-uren week (12 vrije dagen op jaarbasis);
  • 8 bijkomende vakantiedagen buiten de wettelijke vakantie;
  • hospitalisatieverzekering en verzekering gewaarborgd inkomen;
  • maaltijdcheques t.w.v. 4,00 EUR/dag (8u);
  • verschillende kinderopvangmogelijkheden.

Interesse?

Ben je geïnteresseerd, solliciteer dan uiterlijk voor 25 september 2020 online via www.uzatrektaan.be

Vragen over deze functie? Contacteer mij!


 
 
Kathleen Dekeirel
 
038213899





Ga terug

UZA trekt aan is de jobsite van het © Universitair Ziekenhuis Antwerpen, Wilrijkstraat 10, 2650 Edegem